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鎳柱純化常見問題及分析
  • 發(fā)布日期:2018-03-19      瀏覽次數(shù):19218
    • 1:通過His標簽純化的蛋白,雜帶比較多,如何改進?

      (1)如果純化的是上清,蛋白酶會部分降解目的蛋白,可通過加多種入蛋白酶抑制劑改進。

      (2)可提高雜蛋白與鎳柱結合起始咪唑濃度,以降低雜蛋白與鎳柱的親和力。

      (3)雜蛋白和目的蛋白結合,可通過超聲前加入去垢劑的方式消除(1%-2%Tritonx-100)。

      2:鎳柱使用中出現(xiàn)棕色是怎么回事?

      (1)出現(xiàn)這樣的情況,主要是緩沖液中DTT的影響,DTT會對鎳柱的顏色和純化效率有很大的影響,在堿性的緩沖液條件下,鎳離子會被DTT還原生成棕色的沉淀,所以所有鎳柱的生產(chǎn)商都強調要盡量避免DTT的參與(一般的鎳柱耐受小于5mMDTT,推薦緩沖液中不要超過2mMDTT)。

      3:柱子堵了,怎么辦?

      (1)柱子發(fā)生堵塞,可能是樣品中細胞碎片或其他雜顆粒所致,所以樣品一定要高速離心。

      (2)上清液純化時,蛋白發(fā)生變性,有絮狀物產(chǎn)生,趕緊加入1-2mMDTT(上清樣品處理要在冰浴中進行),還不行加尿素變性,使其在變形環(huán)境下。

      (3)樣品處理時的料液比不要太小,否則黏度大,或者導致蛋白析出或變性,料液比要在1/10-1/15之間較適宜。

      4:純化過程中,蛋白出現(xiàn)了渾濁,怎么辦?

      (1)出現(xiàn)渾濁,說明蛋白處在不穩(wěn)定的環(huán)境中或者自身就不穩(wěn)定,所以要檢查緩沖體系是否正確,環(huán)境是否低溫,或在緩沖液中加入還原劑DTT。

      (2)加入肌氨酸鈉,迅速使蛋白變性,消除渾濁現(xiàn)象。

      5:沒能純化到帶His標簽的蛋白,蛋白都流穿了(未掛柱)?

      (1)超聲的功率不對(太大,蛋白炭化,太小,蛋白沒有釋放)策略:改變超聲功率,并在超聲前加入溶菌酶。

      (2)樣品或者是結合緩沖液不正確:策略:檢測pH及樣品和結合緩沖液的組成份(EDTA等)。確保在溶液中鰲合劑或強還原劑的濃度及起始咪唑的濃度不是太高。

      (3)組氨酸的標簽沒有*的暴露策略:在變性條件下(用8M脲,6M鹽酸胍,1%SDS)并加入1-2mMDTT進行純化。

      (4)His標簽丟失,策略1:WB或者anti-his的抗體檢查His是否表達,上游構建,改變his-tag的位(C-terminalorN-terminal),必要時增加his個數(shù)(常用6-10個)。策略2:孵育的時間不夠,降低流速和增加孵育的時間。策略3:改變螯合的金屬離子,尋找到*的結合金屬離子。

      Ni2+通常是從宿主細胞蛋白中純化大多數(shù)(組氨酸)6標記的重組蛋白質的金屬離子,也是一般zui常用的離子。蛋白和金屬離子之間的結合強度受幾種因素影響,包括長度、位置、親和標記在蛋白的暴露程度、所用離子的類型、以及緩沖液的pH,因此一些蛋白用其他離子可能更容易地進行純化而不用Ni2+??梢岳肏itrapIMACHP來篩選不同的金屬離子,具體應用實例請參考《RecombinantProteinPurificationHandbook》。

      6:蛋白掛在柱子上洗脫不下來,怎么解決?

      (1)洗脫條件太溫和(組氨酸標記的蛋白質仍然結合在柱上,結合力較強)策略:用增加咪唑的梯度洗脫或降低pH來找出*的洗脫條件。

      (2)降低PH的方法洗脫的,因為若PH低于3.5,會導致鎳離子脫落策略:改變洗脫辦法,咪唑競爭性洗脫

      (3)蛋白已沉淀在柱上 策略:減少上樣量和孵育的時間,試用去污劑(1%-2%Tritonx-100)
      或改變NaCl的濃度,或在變性條件下洗脫(用8M脲,或6M鹽酸胍),zui終也可在洗脫Buffer中加入2mMDTT或者0.5%肌氨酸鈉進行洗脫。

      (4)非特異性疏水或其他相互反應策略:加非離子去污劑到洗脫緩沖液(如,2%TritonX-100)或增加NaCl的濃度。

      7:如何處理樣品,可使其初步提純(如何洗去蛋白的自身帶)?

      (1)上清樣品處理,要加入去污劑,蛋白酶抑制劑,還原劑,還要注意溫度及超聲破碎的參數(shù)。

      (2)去大腸桿菌自身帶(兩條30KD-40KD)可用非變性緩沖液超聲懸浮(加入去垢劑),離心6000r/min,30min,10℃。(若效果不夠可繼續(xù)上述步驟)。

      (3)大腸桿菌包涵體的洗滌,可用包涵體洗液多洗幾遍,也可用1M/2M/4M/8M尿素逐步溶解,可選取其中純度*的。

      (4)可用硫酸銨測定法,可初步提純。

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